Подготовка кадров высшей квалификации ведется в аспирантуре по специальности «Общественное здоровье и здравоохранение» открыта с 2004 года. С 2014 года переименовано по направлению подготовки кадров высшей квалификации 32.06.01 «Медико-профилактическое дело». Прием на обучение по программе аспирантуры проводится ежегодно.