Отдел проводит комплексное социально-гигиеническое исследование состояния здоровья населения, с учетом причин и факторов, его формирующих.
Сотрудники занимаются разработкой и реализацией методологии готовых к внедрению методик оценки и повышения эффективности деятельности здравоохранения за счет снижения преждевременных и предотвратимых потерь здоровья населения РФ. Они оценивают и прогнозируют демографические процессы в обществе, анализируют статистику по здоровью и заболеваемости в России и факторы, на это влияющие. Исходя из полученных данных, отдел разрабатывает основные проекты положений государственной политики по охране здоровья населения, по медицинскому обеспечению профилактики.
Отдел ведет методическое сопровождение по применению основных форм учетной и отчетной медицинской документации, используемой в медицинских организациях, участвует в формировании статистических форм и медицинской документации в системе здравоохранения.
Важная задача - проведение мониторинга изучения потребления психоактивных веществ среди молодежи и выявление факторов риска, способствующих развитию алкоголизации, табакокурения и употребления наркотиков. Данные мониторинга тиражируются среди различных учреждений и организаций, проводящих профилактику в молодежной среде. Также отдел участвует в разработке профилактической системы с представителями органов здравоохранения и образования, МВД, комитетов по делам молодежи, физкультуре, спорту и туризму.
Среди других видов деятельности - изучение состояния здоровья семьи, женщин и мужчин репродуктивного возраста, детей; анализ перинатальной заболеваемости и смертности; младенческой, детской и материнской смертности. Отдел изучает влияние разных факторов на формирование здоровья и развитие патологии у детей, разрабатывает научную методологию проведения комплексной оценки состояния здоровья детей России.
Также отдел поддерживает функционирование и обеспечение дальнейшего развития фактографической автоматизированной информационно справочной системы ФАИСС "Потенциал" о смертности населения по административным регионам РФ. Развивает методологию мониторинга и оценки потерь здоровья населения, участвует в подготовке учебных программ и кадров в сфере общественного здоровья и здравоохранения.