В соответствии с уставом учреждения ключевые цели деятельности ЦНИИОИЗ Минздрава России включают:
Эти исследования соответствуют приоритетным направлениям Стратегии научно-технического развития и способствуют достижению национальных целей развития Российской Федерации.
В качестве приоритетных научно-исследовательских тематик определены десять направлений: «Кадровая политика в здравоохранении», «Демография», «Общественное здоровье», «Экономика здравоохранения», «Оценка эффективности и результативности системы здравоохранения», «Разработка организационных решений для здравоохранения», «Социологические исследования в здравоохранении», «Территориальное планирование» и ряд других. Перечень приоритетных направлений научных исследований ежегодно обновляется и актуализируется с учетом результатов системного анализа, посвященного изучению фронтиров науки и запросов системы здравоохранения.
Научно-исследовательская деятельность осуществляется в рамках выполнения государственных заданий, темы которых определяются и согласуются Министерством здравоохранения Российской Федерации, а также в рамках отдельных проектов и диссертационных исследований.
Работа научного экспертного сообщества Института реализуется через следующие органы:
Общая деятельность научного экспертного сообщества ориентирована на развитие научного потенциала Института и укрепление его лидирующих позиций в области общественного здоровья, организации и экономики здравоохранения, цифровой трансформации системы здравоохранения.